五、常用贮存液的配制
[b]1.30%丙烯酰胺溶液[/b] 【配制方法】 将29g丙烯酰胺和1g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。用Nalgene滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。 【注意】 丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能会含有少量未聚合材料。 一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子,在丙烯酰胺贮存液中加入大约0.2体积的单床混合树脂(MB-1Mallinckrodt),搅拌过夜,然后用Whatman 1号滤纸过滤以纯化之。 在贮存期间,丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。 [b]2.40%丙烯酰胺[/b] 【配制方法】 把380g丙烯酰胺(DNA测序级)和20g N,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理,但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。 【注意】 见上述配制30%丙烯酰胺的说明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。 [b]3.放线菌素D溶液[/b] 【配制方法】 把20mg放线菌素D溶解于4ml 100%乙醇中,1:10稀释贮存液,用100%乙醇作空白对照读取OD[SB]440[/SB]值。放线菌素D(分子量为1255)纯品在水溶液中的摩尔消化系数为21,900,故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为0.182,放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中,保存于-20℃。 【注意】 放线菌素D是致畸剂和致癌剂,配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操作,而不能在开放在实验桌面上进行,谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。 药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度,这类制品便可用于抑制自身引导作用。 [b]4.0.1mol/L腺苷三磷酸(ATP)溶液[/b] 【配制方法】 在0.8ml水中溶解60mgATP,用0.1mol/L NaOH调至pH值至7.0,用蒸馏水定容1ml,分装成小份保存于-70℃ [b]5.10mol/L乙酸酰溶液[/b] 【配制方法】 把770g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后过滤除菌。 [b]6.10%过硫酸铵溶液[/b] 【配制方法】 把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中,该溶液可在4℃保存数周。 [b]7.BCIP溶液[/b] 【配制方法】 把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐(BCIP)溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃ [b]8.2×BES缓冲盐溶液[/b] 【配制方法】 用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BES[N,N-双(2-羟乙基)-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na[XB]2[/XB]HPO[XB]4[/XB],室温下用HCl调节 该溶液的pH值至6.96、然后加入蒸馏水定容至100ml,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成小份,保存于-20℃。 [b]9.1mol/L CaCl[XB]2[/XB]溶液[/b] 【配制方法】 在200ml蒸馏水中溶解54gCaCl[XB]2[/XB]·6H[XB]2[/XB]O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成10ml小份贮存于-20℃。 【注意】 制备感受态细胞时,取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml,用Nalgene滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,然后骤冷至0℃。 [b]10.2.5mol/L CaCl[XB]2[/XB]溶液[/b] 【配制方法】 在20ml蒸馏水中溶解13.5gCaCl[XB]2[/XB]·6H[XB]2[/XB]O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。 [b]11.1mol/L二硫苏糖醇(DTT)溶液[/b] 【配制方法】 用20ml 0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)溶解3.09g DTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。 【注意】 DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。 [b]12.脱氧核苷三磷酸(dNTP)溶液[/b] 【配制方法】 把每一种dNTP溶解于水至浓度各为100mmol/L左右,用微量移液器吸取0.05mol/l Tris碱分别调节 每一dNTP溶液的pH值7.0(用pH试纸检测),把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释,在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度,然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的dNTP,分装成小份贮存于-70℃。碱基 | 波长(nm) | 消化系数(ε)[L/(mol·cm)] |
A | 259 | 1.54×10[SB]4[/SB] |
G | 253 | 1.37×10[SB]4[/SB] |
C | 271 | 9.10×10[SB]3[/SB] |
T | 260 | 7.40×10[SB]3[/SB] |
试剂 | 用途 |
Denhardt试剂 | Northern杂交 |
使用RNA探针的杂交 | |
单拷贝序列的Southern杂交 | |
将DNA固定于尼龙膜上的杂交 | |
Denhardt试剂通常配制50×贮存液,过滤后保存于-20℃。可将该贮存液10倍稀释于预杂交液(常为含有0.5%SDS和100μg/ml经变性被打断的鲑精DNA的6×SSC或6×SSPE)中。50×Denhardt液中含5g聚蔗糖(Ficoll,400型,Pharmacia)、5g聚乙烯吡咯烷酮和5g牛血清白蛋白(组分V”Sigmal),加水至终体积为500ml。 | |
BLOTTO | Grunstein-Hogness杂交 |
Benton-Davis杂交 | |
除单拷贝序列Southern杂交以外的所有Southern杂交 | |
斑点印迹 | |
1×BLOTT(牛乳转移技术优化液,Bovine Lacto Transfer Technique Optimizer),是含5%胶脂奶粉和0.02%叠氮钠的水溶液,应保存于4℃。使用前可用预杂交液稀释25倍。BLOTTO不应与高浓度的SDS并用,因为后者会导致牛奶中蛋白质析出。如果杂交背景不合要求,可在杂交液中加入NP-40至终浓度为1%。BLOTTO不能用作Northern杂交的封闭剂,因为这一封闭剂中可能含有RNA酶,其活性之高使人无法接受。 | |
注意:叠氮钠有毒性,取用时需戴手套小心操作。含叠氮钠的溶液应予明确标记。 | |
肝素 | Southern杂交 |
原位杂交 | |
肝素(Sigma H-7005,从猪中提取的二级产品或相当等级的产品)用4×SSPE或4×SSC溶解配制成50mg/ml的浓度,保存于4℃。肝素在含有葡聚糖硫酸酯的杂交液中用作封闭剂的浓度为500μg/ml,在不含葡聚糖硫酸酯的杂交液中的浓度为50μg/ml。 | |
经变性并被打断的鲑精DNA | southern和Northern杂交 |
把鲑鱼精子DNA(Sigma,Ⅲ,盐钠)溶解于水配制成10mg/ml的浓度,必要时于室温磁力搅拌2~4h助溶。把溶液中NaCl的浓度调至0.1mol/L,并用酚和酚/氯仿各抽提一次,回收水相。合DNA溶液快速通17号皮下注射针头12次,以剪切DNA。加入2倍体积用冰预冷的乙醇沉淀DNA。离心回收DNA并重溶于水,配制成10mg/ml的浓度,测定溶液的OD[XB]260[/XB]值并计算出精确的DNA浓度,然后煮沸10min,分装成小份保存于-20℃。使用前置沸水浴中加热5min,然后迅速在冰浴中骤冷。预杂交液中应含有100μg/ml经变性并被打断的鲑鱼精子DNA |