二、关于探针的标记
[b](一)cRNA探针的同位素标记[/b]
1.标记液(转录标记)
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan137.jpg[alt] 标记液(转录标记)[/alt][/img]
2.转录缓冲液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan138.jpg[alt]转录缓冲液 [/alt][/img]
※:用地高辛或生物素标记时,用UTP替代。
3.标记终止液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan139.jpg[alt]标记终止液[/alt][/img]
4.标记探针水解液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan140.jpg[alt]标记探针水解液 [/alt][/img]
先用dH[XB]2[/XB]O悬浮探针,再加入后两种试剂,轻轻振摇混合,于60℃条件下反应。
5.探针水解时间
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan141.jpg[alt]探针水解时间 [/alt][/img]
注:L[XB]O[/XB]-探针初始长度(kb)
L[XB]f[/XB]-探针的终长度(kb)
K-0.11kb/min
6.探针水解终止液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan142.jpg[alt]探针水解终止液 [/alt][/img]
每次加入充分混合,临用前配。
7.探针沉淀液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan143.jpg[alt]探针沉淀液 [/alt][/img]
每次加入,充分混合,新鲜配制。
[b](二)寡聚核苷酸3’端标记(cRNA探针)[/b]
1.标记反应液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan144.jpg[alt] 标记反应液[/alt][/img]
2.终止液:0.2mol/L EDTA
3.探针沉淀液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan145.jpg[alt]探针沉淀液 [/alt][/img]
(三)cRNA探针非同位素标记(地高辛及生物素)
1.标记液
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan146.jpg[alt]标记液 [/alt][/img]
△:生物素标记时为10mmol/L的生物素-11-UTP
※:为检测标记率而加。
2.转录标记终止液
(1)0.2mol/L EDTA:用于地高辛标记法
(2)生物素标记终止液:
[img]https://baike.zhuayao.net/Uploads/zyzy/lilunshuji/shiyongmianyixibaoyuhesuan/shiyongmianyixibaoyuhesuan147.jpg[alt]生物素标记终止液: [/alt][/img]
[b](四)DNA探针标记常用试剂的配制[/b]
(1)10 ×缺口平移缓冲液:200mmol/l Tris-HCl,pH7.4含50mmol/L MgCl[XB]2[/XB];100mmol/Lβ-巯基乙醇、1mg/ml BSA。
(2)缺口平移反应终止液:200mmol/L NaCl;10mmol/l Tris-HCl,pH7.4;11mmol/L EDTA; 0.5% SDS。
(3)DNaseⅠ:干粉状DNaseⅠ(2000~3000u/mg)溶于20mmol/l Tris-HCl, pH7.5中(1mg/ml),10μl分装,-20℃保存一年。
(4)10×DNA聚合酶Ⅰ(Klenow片段)缓冲液:500mmol/l Tris-HCl,pH6.6;100mmol/L Mg-Cl[XB]2[/XB];10mmol/L DTT;0.5mgBSA。
(5)10×激酶缓冲液:500mmol/L Tris-HCl,pH7.4,50mmol/L MgCl[XB]2[/XB];20mmol/LDTT; 1.0mmol/L亚精胺。
(6)10×随机引物标记缓冲液;500mmol/l Tris-HCl,pH6.6;100mmol/L MgCl[XB]2[/XB];10mmol/Lβ-巯基乙醇;500μg/ml BSA。
(7)1×加尾缓冲液:100mmol/L二甲胂化钾,pH7.0,1mmol/l CoCl[XB]2[/XB]0.2mmol/L DTT。
(8)1mol/L MgCl[XB]2[/XB]:MgCl[XB]2[/XB]47.60g溶于500ml水中,100ml分装,高压灭菌,室温保存。
(9)0.25mol/L EDTA(Ph8.0):EDTA 52.02g溶于400ml水中,调pH至8.0,加水至500ml,100ml分装,高压灭菌,室温保存。
(10)4mol/L醋酸钠:取无水醋酸钠82g溶于200ml水中,用醋酸调pH至6.5,加水至250ml,高压灭菌,或0.45μm膜过滤,室温保存。
(11)10% SDS:10g SDS(十二烷基硫酸钠)溶于50ml水中,加水至100ml,分装后室温保存。
(12)20×SSC:取NaCl 175.3g;柠檬酸钠88.2g;加水至1000ml,用10mol/l NaOH调pH至7.0;高压灭菌,室温保存。
(13)无菌水:100ml去离子水或双蒸水,分装,高压灭菌,室温保存,开瓶后仅限一周使用。
(14)10×激酶缓冲液:500mmol/L Tris-HCl,pH7.4;100mmol/L MgCl[XB]2[/XB];50mmol/lDTT;10mmol/L亚精胺(非必需)。
(15)T[XB]4[/XB]多聚核苷酸激酶:10u/μl,保存在甘油中,-20℃。
(16)TE缓冲液(Tris/EDTA):Tris,10mmol/l pH7.4(0.5ml 2mol/L贮存液),1.0mmol/l ED-TA,pH8.0(20μl 0.5mol/L)贮存液,加水至100ml,室温保存。
(17)2mol/L Tris-HCl pH7.4:Tris242.2g溶于850ml,加浓HCl 75ml ,边加边缓慢搅动,至pH7.4,于加水至1000ml。
(18)1mol/L DTT(二硫苏糖醇):3.0g DTT溶于20ml水中,分装,于-20℃贮存。
(19)0.5mol/L EDTA(乙二胺四乙酸二钠盐):在烧杯中先加入300ml水,加入93.5g EDTA-Na[XB]2[/XB]·2H[XB]2[/XB]O,充分混匀,加10mol/l NaOH调pH至8.0,加水至500ml。
(20)10mol/L NaOH:200g NaOH溶于450ml水中,混匀,再加水至500ml。
(21)5mol/L NaCl:292.25g NaCl,加水至1000ml。
(22)1mol/L HCl:加86.2ml浓盐酸至913.8ml水中。
(23)1mol/L CaCl[XB]2[/XB]:147g CaCl[XB]2[/XB]:2H[XB]2[/XB]O,溶于1000ml水中,高压灭菌,室温保存。