一、PCR操作范例

在一个典型的PCR反应体系中需加入:适宜的缓冲液、微量的模板DNA、4×dNTPs、耐热性多聚酶、Mg[SB]2+[/SB]和两个合成的DNA引物。模板DNa 94℃变性1min,引物与模板40~60℃退火1min,72℃延伸2min。在首次循环前模板预变性3~5min;在末次循环后,样品仍需继续延伸3~5min以上,确保扩增的DNA为双链DNA。为便于了解PCR反应中各成份的组成,加入量和反应条件,使人们以此为基础,对不同的研究对象逐项改变来找到最佳反应条件,特列举Perkin Elmer Cetus公司Gene Amp DNA试剂盒提供的典型反应条件供参考。 表22-1 PCR反应混合液
成分加入体积(μl)最终浓度
双蒸馏水53.5 
10×反应缓冲液[SB][1][/SB]10.0[1×]Mg[SB]2+[/SB]1.5mmol/l K[SB]+[/SB]50mmol/L
4×dNTPs(各1.25mmol/L)16.0各200μmol/L
λ-DNA模板(全长48.5kD)10.01ng/次
引物1,2(各25bp,20μmol/L)[SB][3,4][/SB]5.01.0μmol/L(100pmol)
Taq聚合酶储存液[SB][2][/SB]0.52U/100μl
总体积(pH8.3)100.0 
石蜡油50~100.0 
扩增条件:94℃60s,37℃60s,72℃120s,共25~30个循环。 注:[1]反应缓冲液[10×]含:100mmol/l Tris-HCl pH8.3(25℃), 15mmol/L KCl, 15mmol/L MgCl[XB]2[/XB], 0.01%(W/V)明胶(Sigma G2500) [2]酶储存缓冲液(-20℃)含:50%甘油,100mmol/l KCl, 20mmol/L Tris-HCl ph8.0 0.1mmol/L EDTA, 1.0mmol/L DTT 200μg/ml明胶 0.5%吐温20,0.5% Nonidet P40 [3][4]引物,1,2:扩增λ-噬菌体基因中500bp的片段 引物1序列:7131~7155(5’)-GATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGG-(3’) 引物2序列:7606~7630(5’)-GGTTATCGAAATCAGCCACAGCGCC-(3’) 注意(3’)端有2个bp互补故易生成50bp的双体